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將克隆化基因插入合適載體后導入大腸桿菌用于表達大量蛋白質(zhì)的方法一般稱(chēng)為原核表達。這種方法在蛋白純化、定位及功能分析等方面都有應用。大腸桿菌用于表達重組蛋白有以下特點(diǎn):
易于生長(cháng)和控制;用于細菌培養的材料不及哺乳動(dòng)物細胞系統的材料昂貴;有各種各樣的大腸桿菌菌株及與之匹配的具各種特性的質(zhì)??晒┻x擇。但是,在大腸桿菌中表達的蛋白由于缺少修飾和糖基化、磷酸化等翻譯后加工,常形成包涵體而影響表達蛋白的生物學(xué)活性及構象。
表達載體在基因工程中具有十分重要的作用,原核表達載體通常為質(zhì)粒,典型的表達載體應具有以下幾種元件:
(1)選擇標志的編碼序列;
(2)可控轉錄的啟動(dòng)子;
(3)轉錄調控序列(轉錄終止子,核糖體結合位點(diǎn));
(4)一個(gè)多限制酶切位點(diǎn)接頭;
(5)宿主體內自主復制的序列。
原核表達一般程序如下:
獲得目的基因-準備表達載體-將目的基因插入表達載體中(測序驗證)-轉化表達宿主菌-誘導靶蛋白的表達-表達蛋白的分析-擴增、純化、進(jìn)一步檢測
一、試劑準備
1、LB培養基。
2、100mM IPTG(異丙基硫代-β-D-半乳糖苷):2.38g IPTG溶于100ml ddH2O中,0.22μm濾膜抽濾,-20℃保存。
二、操作步驟
(一)獲得目的基因
1、通過(guò)PCR方法:以含目的基因的克隆質(zhì)粒為模板,按基因序列設計一對引物(在上游和下游引物分別引入不同的酶切位點(diǎn)),PCR循環(huán)獲得所需基因片段。
2、通過(guò)RT-PCR方法:用TRIzol法從細胞或組織中提取總RNA,以mRNA為模板,逆轉錄形成cDNA第yi鏈,以逆轉錄產(chǎn)物為模板進(jìn)行PCR循環(huán)獲得產(chǎn)物。
(二)構建重組表達載體
1、載體酶切:將表達質(zhì)粒用限制性?xún)惹忻福ㄍ锏拿盖形稽c(diǎn))進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物行瓊脂糖電泳后,用膠回收Kit或凍融法回收載體大片段。
2、PCR產(chǎn)物雙酶切后回收,在T4DNA連接酶作用下連接入載體。
(三)獲得含重組表達質(zhì)粒的表達菌種
1、將連接產(chǎn)物轉化大腸桿菌DH5α,根據重組載體的標志(抗Amp或藍白斑)作篩選,挑取單斑,堿裂解法小量抽提質(zhì)粒,雙酶切初步鑒定。
2、測序驗證目的基因的插入方向及閱讀框架均正確,進(jìn)入下步操作。否則應篩選更多克隆,重復亞克隆或亞克隆至不同酶切位點(diǎn)。
3、以此重組質(zhì)粒DNA轉化表達宿主菌的感受態(tài)細胞。
(四)誘導表達
1、挑取含重組質(zhì)粒的菌體單斑至2ml LB(含Amp50μg/ml)中37℃過(guò)夜培養。
2、按1∶50比例稀釋過(guò)夜菌,一般將1ml菌加入到含50mlLB培養基的300ml培養瓶中,37℃震蕩培養至OD600 ≌0.4-1.0(OD600 0.6,大約需3hr)。
3、取部分液體作為未誘導的對照組,余下的加入IPTG誘導劑至終濃度0.4mM作為實(shí)驗組,兩組繼續37℃震蕩培養3hr。
4、分別取菌體1ml,離心12000g×30s收獲沉淀,用100μl 1%SDS重懸,混勻,70℃10min。
5、離心12000g×1min,取上清作為樣品,可做SDS-PAGE等分析。
三、注意事項
1、選擇表達載體時(shí),要根據所表達蛋白的終應用考慮。如為方便純化,可選擇融合表達;如為獲得天然蛋白,可選擇非融合表達。
2、融合表達時(shí)在選擇外源DNA同載體分子連接反應時(shí),對轉錄和轉譯過(guò)程中密碼結構的閱讀不能發(fā)生干擾。