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細胞污染是細胞生物學(xué)實(shí)驗室中常見(jiàn)的情形。細胞污染通常分為微生物污染和真核生物污染。微生物污染指的是真菌、細菌、支原體等的污染。微生物污染容易辨識,可通過(guò)肉眼和利用顯微鏡觀(guān)察培養基的顏色變化進(jìn)行判斷。細菌污染通常使培養基變黃,且顯微鏡下有小黑點(diǎn),酵母污染的培養基變紫色,顯微鏡下可見(jiàn)透明成串的圓形斑。但支原體污染較難看出,因為支原體的生長(cháng)較慢,因此很容易被忽略。真核生物污染是由于實(shí)驗員操作不當發(fā)生的細胞系之間的交叉污染。為避免細胞污染造成深遠的影響,細胞鑒定萬(wàn)不可少。
細胞系的鑒定主要圍繞四個(gè)方面進(jìn)行:
1、種系來(lái)源:常用技術(shù)包括STR分型,限制片段長(cháng)度多態(tài)性(AFLP),染色體組分析,同工酶分析,人淋巴細胞抗原(HLA)分型。STR分型是重要的種系來(lái)源判斷手段。STR位點(diǎn),又被稱(chēng)為微衛星,是3-7 bp的短串聯(lián)重復序列,具有高度多態(tài)性,被稱(chēng)為細胞的DNA圖譜指紋,因此可以進(jìn)行STR分型,通過(guò)與專(zhuān)業(yè)數據庫比對,判斷樣本所屬細胞系。
2、組織來(lái)源:常用技術(shù)包括形態(tài)學(xué)手段、免疫組化分析。形態(tài)學(xué)手段是利用不同組織可能具有特殊的形態(tài)學(xué)結構判斷組織來(lái)源。免疫組化是利用標記的抗體定位組織特異性抗原來(lái)確定細胞的組織來(lái)源。
3、特異性功能檢測:根據細胞種類(lèi)和功能,采用特異性指標鑒定細胞。比如,腺細胞產(chǎn)生分泌蛋白或者激素。腫瘤細胞需要具備腫瘤組織的特性。
4、是否發(fā)生轉化和惡變:常用技術(shù)包括核型分析、細胞生長(cháng)行為觀(guān)察(是否接觸抑制)、裸鼠成瘤實(shí)驗等。核型分析包括對染色體數目、形態(tài)、組成的研究,常用到染色體染色技術(shù)。核型分析可揭示染色體是否發(fā)生畸變、細胞功能、進(jìn)化活動(dòng)和分裂關(guān)系。長(cháng)期傳代可能會(huì )造成染色體畸變,因此需要定期檢查染色體核型。正常細胞在培養過(guò)程中可能會(huì )轉化,獲得永生性或者惡型性。因此需要鑒定來(lái)區分正常細胞或者腫瘤細胞。
腫瘤細胞鑒定
對于腫瘤細胞,需要鑒定其是否保留腫瘤組織的特性,因此需要進(jìn)行一些鑒定步驟,包括集落形成實(shí)驗、成瘤性檢測和正常組織侵襲實(shí)驗等。
a. 細胞集落形成實(shí)驗:癌細胞株對培養條件的適應性較強、獨立生存能力也較強,細胞集落率更高。因此可以通過(guò)測定細胞集落形成率,判斷細胞的生長(cháng)能力,從而判定是否為無(wú)限細胞系。
b. 成瘤性檢測:將腫瘤細胞注射進(jìn)入裸鼠體內,檢測是否能在裸鼠體內形成腫瘤。
c. 正常組織侵襲實(shí)驗:該實(shí)驗是檢測腫瘤細胞是否對正常組織具有侵襲和轉移的能力。
d. 其他:其他還包括對于密度依賴(lài)生長(cháng)特性改變(接觸抑制)、分子水平特征的鑒定。接觸抑制是判定腫瘤和正常細胞的重要依據。
干細胞鑒定
干細胞的重點(diǎn)是檢測細胞的多能性。常規鑒定方法包括核型分析、擬胚體(EB)形成分析、三胚層分化檢測、堿性磷酸酶染色、多能性標志物檢測和畸胎瘤檢測等。
a. EB分化檢測:EBs是人誘導多能干細胞的三維聚集物,即是干細胞多能性的標志。EB分化檢測的流程是:將EB接種于含血清的培養基中自發(fā)分化,然后利用流式檢測三胚層表面標志物,判定多能性。
b. 三胚層分化檢測:分別將胚胎干細胞或者誘導多能干細胞向三胚層分化培養,分別檢測特定胚層的標志物,從而判斷其多能性。
c. 堿性磷酸酶(Ap)染色:未分化的干細胞會(huì )高水平表達Ap。通過(guò)對固定的干細胞染色,分化的細胞無(wú)色,未分化的細胞呈現紫色或者紅色。Ap染色是一種低成本、簡(jiǎn)單快速的方法。
d. 多能性標志物檢測:未分化狀態(tài)的ES和iPS能表達特定的表面標志物,包括TRA-1-81、TRA-1-60、SSEA-3、SSEA-4、Nanog、SOX2、Oct4等。
e. 畸胎瘤檢測:將一定數量的干細胞注射進(jìn)入免疫缺陷小鼠體內, 4-12周后,多能干細胞能生成畸胎瘤?;チ霭巳齻€(gè)胚層的組織,可通過(guò)組織學(xué)手段檢測。但是該方法耗時(shí)費力,費用大。